Σύμφωνα με τα μέχρι στιγμής στοιχεία, ελέγχονται προς το παρόν τέσσερα άτομα τα οποία φέρονται να εμπλέκονται σε αξιόποινες πράξεις. Από αυτούς, μόνο ο πατήρ Αντώνιος ελέγχεται προς στιγμήν για εγκλήματα που ανάγονται στη γενετήσια σφαίρα, ενώ οι υπόλοιποι 3, οι οποίοι είναι εργαζόμενοι σε δομές της «Κιβωτού του Κόσμου», ερευνώνται για σωματικές βλάβες πλημμεληματικού χαρακτήρα, αφού σε βάρος τους έχουν γίνει αναφορές πως εξανάγκαζαν παιδιά που φιλοξενούνταν στη δομή σε εργασία, σε απομόνωση από το σχολείο, σε ξυλοδαρμό και άλλες αξιόποινες πράξεις.
Τη διερεύνηση της δικογραφίας έχουν αναλάβει δύο εισαγγελείς Πρωτοδικών (Δάφνη-Κυριακή Τσιχλή και Αικατερίνη Κοπελάκη), οι οποίες έχουν στείλει τις πρώτες κλήσεις σε μάρτυρες, με σκοπό την άμεση διαλεύκανση της υπόθεσης, ώστε καταλήξουν σε συμπεράσματα για το αν προκύπτουν αξιόποινες πράξεις. Δεν αποκλείεται μάλιστα δικογραφίες που ενδεχομένως έχουν σχηματιστεί σε άλλες πόλεις της Ελλάδας, όπου υπάρχουν δομές της «Κιβωτού», να συνενωθούν με τη δικογραφία που βρίσκεται αυτή τη στιγμή στα χέρια του εισαγγελέα Ανηλίκων της Εισαγγελίας Πρωτοδικών Αθηνών.
Σύμφωνα με πληροφορίες, ο Συνήγορος του Πολίτη είχε αρχικά διαβιβάσει δύο διαδοχικά e-mails προς την Εισαγγελία στα τέλη του περασμένου Αυγούστου. Τότε, σε αυτές τις ηλεκτρονικές επιστολές, δεν υπήρχε άμεση αναφορά παθόντα για σεξουαλική κακοποίηση. Οι καταγγελίες αφορούσαν σε κακοποίηση, σωματικές τιμωρίες κ.λπ.
Η Εισαγγελία είχε διαβιβάσει το φάκελο της δικογραφίας στο Τμήμα Ανηλίκων της ΓΑΔΑ, προκειμένου να γίνει ενδελεχής έρευνα των καταγγελλομένων. Στην πορεία της έρευνας αυτής, εκλήθησαν σε προανακριτικές καταθέσεις επτά άτομα, ο ένας εκ των οποίων είναι ο 19χρονος που έχει καταγγείλει τον πατέρα Αντώνιο για σεξουαλική κακοποίηση.
Η συγκεκριμένη προανακριτική κατάθεση δόθηκε στις 16 Νοεμβρίου, με το περιεχόμενό της να έρχεται στη δημοσιότητα σχεδόν ακαριαία, κάτι που οδήγησε την Εισαγγελία στην απόφαση να αφαιρεθεί άμεσα η δικογραφία από την Υποδιεύθυνση Ανηλίκων της ΓΑΔΑ και να επιστραφεί στην Εισαγγελία Ανηλίκων, η οποία πλέον αναλαμβάνει το σύνολο της διερεύνησης της υπόθεσης.
Ειδήσεις σήμερα